肇源縣地處哈爾濱、大慶、長春“金三角”中心,境內(nèi)鐵路、公路、水路四通八達(dá),松花江大橋連接黑吉兩省,是黑龍江省西南部的區(qū)域性物流節(jié)點(diǎn)和南下入關(guān)、北上內(nèi)蒙的重要通道。公路方面,林肇路、明沈路、五肇路穿境而過,哈肇高速進(jìn)一步加強(qiáng)與省會的聯(lián)系,G45大慶-廣州高速、G232牙克石至四平國道是打通黑龍江省西南部、吉林省西北部和內(nèi)蒙古東部的省級重要通道。鐵路方面,新肇火車站為二級站,依托通讓鐵路建設(shè)的沈鐵內(nèi)陸港,年到發(fā)能力380萬噸,開通了昆明、濟(jì)南、上海、成都等五個限制港,與錦州港、大連港、營口港等五個港口聯(lián)檢;規(guī)劃的松原經(jīng)肇源到肇東鐵路已列入黑龍江省城鎮(zhèn)化規(guī)劃重點(diǎn)項目。水路方面,肇源新港是黑龍江省第四大港口,上行可進(jìn)入韃靼海峽入海,下行可至佳木斯、同江等地,是港路聯(lián)動、江海聯(lián)運(yùn)、鐵海聯(lián)通的重要通道。
肇源縣擁有6500年的歷史,這里曾為遼金腹地,元清王公世襲之所,既是遼國齊天皇后的故鄉(xiāng),也是完顏阿骨達(dá)肇基王績之地。
據(jù)“白金寶文化”等遺址發(fā)掘考證,商周時代縣境屬肅慎部。秦漢時為穢貊地。后漢三國時屬扶余國,《后漢書》載“夫(音扶)余國在玄菟北千里,南與高句麗,東與挹婁,西與鮮卑接,北有弱水,地方兩千里,本濊地也”。北魏時屬勿吉(音莫吉)國,“乃舊肅慎國也”。”北齊河清二年(563年)勿吉始稱林朝?!岸惵贩譃槠卟浚衅蹦┎?、伯咄部、安車骨部、拂涅部、號室部、白山部、黑水部”。黑水部以嫩江下游“大黑水”而得名。通古斯語為“郭爾羅斯”即今肇源縣之舊稱。唐·圣歷三年(698年)三月三十日,唐帝武則天下詔,將妹弱、契丹、突厥、室韋劃為四春、我縣境屬之。唐·開元七年(719年)六月,唐玄宗令黑水諸路為“黑水都督府,其下各部置刺使。開元十三年(725年)”置黑水軍。貞元年間(785——805年),役屬于渤海國,“不復(fù)與(唐)王會矣”。903年契丹夷離堇耶律阿保機(jī)北伐來境。由此,成為契丹人的“戌境內(nèi),居境外”之地。北府宰相蕭思溫在今民意鄉(xiāng)他什海古城建立頭下軍州(皇后店),隸屬上京道。金·收國元年(1115年),縣境劃屬西北路。延設(shè)郭爾羅斯、兀速、結(jié)石烈三個猛安。金·天會八年(1130年),“以太祖兵勝遼,肇基王績于此”在出河店址建立“肇州”(今茂興鎮(zhèn)勒勒營子古城址),同時在其西北五里的莽海古城建始興縣。初隸屬上京路會寧府。海陵時(1149—1161年)“嘗為濟(jì)州支郡”。承安三年(1198年)肇州以“太祖神武隆興之地,升為節(jié)鎮(zhèn),軍名武興?!必懹佣辏?1214年)肇州置招討司。同年,成吉思汗在“裂士分封”中,我縣境為哈布圖哈薩爾的世襲封地的一部分。元·至元三十年(1293年)七月,建立肇州(今肇東市四站鎮(zhèn)八里城古城)隸屬遼陽行省開元路。境內(nèi)沿置兀速(霧松)、憨哈納思(郭爾羅斯)、乞里吉思(給石烈)三個部落。元·至元三十一年(1294年),罷肇州宣慰司,并入遼東道。元·元貞元年(1295年),“立肇州屯田萬戶府,以遼陽行省左丞阿散領(lǐng)之”。元·延右三年,“置肇州女真千戶所”。明·嘉靖二十六年(1547年)六月,蒙古武力東移,哈布圖哈薩爾的十六世孫布巴什惕那顏駐牧嫩江下游兩岸,號所部為“郭爾羅斯”。清·順治五年( 1648年)十二月二日,郭爾羅斯部酋長布木巴被冊封為鎮(zhèn)國公爵,掌郭爾羅斯后旗扎薩克,此為旗治之始。光緒三十二年(1906)設(shè)肇州廳,治所設(shè)在今肇源城。實行蒙漢分治。民國初,省以下設(shè)置沿襲清制,分為道、府、廳、州、縣。民國二年(1913)l月23日,奉大總統(tǒng)令廢府、廳、州,存道、縣由廳改縣后隸屬龍江道,肇州縣城設(shè)今肇源城,名稱肇州,3月20日執(zhí)行。7月肇東分防廳晉升為縣,旗境東部為肇東縣,西部為肇州縣,蒙漢三個政權(quán)并存,繼續(xù)實行蒙漢分治。偽滿洲國屬黑龍江省。
1932年偽縣公署因洪水遷到薄荷窩堡,1934年又因洪水遷到“老城基”(今肇州址)。1934年12月1日結(jié)束蒙漢分治,1935年郭爾羅斯后旗公署由四站老爺屯遷至肇源城,實行旗制。仍用郭爾羅斯后旗名稱,隸屬濱江省。1945年12月20日,民主政府成立。郭爾羅斯后旗隸屬嫩江省,省會在齊齊哈爾。隸屬哈西專員公署。1947年2月7日,黑龍江省和嫩江省合并,稱黑嫩省,本旗屬第四專區(qū),專署駐肇州縣。是年9月17日,撤銷黑嫩省,恢復(fù)黑龍江省和嫩江省建制,本旗仍屬嫩江省。1949年5月5日,嫩江省與黑龍江省合并為黑龍江省,本旗隸屬之。1954年8月1日,黑龍江省與松花江省合并為黑龍江省,原署各縣旗皆屬之。1956年4月 11日,經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn),郭爾羅斯后旗政府奉令改稱肇源縣。此為“肇源縣”之始。1958年8月27日,肇源縣隸屬松花江專署。1965年6月14日,松花江專署改為綏化專署,肇源縣隨屬。1992年劃大慶市管轄。