機構(gòu)職能：番禺海關(guān)是受廣州海關(guān)直接領(lǐng)導(dǎo)，按授權(quán)負責(zé)廣州市番禺區(qū)范圍內(nèi)海關(guān)各類管理工作的正處級隸屬海關(guān)，主要負責(zé)黨的基層建設(shè)和干部隊伍建設(shè)；辦理具體海關(guān)業(yè)務(wù)，反饋執(zhí)法作業(yè)結(jié)果；完成廣州海關(guān)交辦的其他工作。

機構(gòu)設(shè)置：辦公室（黨委辦公室）、人事政工科（黨委組織宣傳部）、財務(wù)裝備科、技術(shù)運維保障科、分析預(yù)警科、綜合業(yè)務(wù)科、稽查科、政務(wù)服務(wù)科、查檢科、衛(wèi)生檢疫科、沙灣監(jiān)管科、珠寶園監(jiān)管科、蓮花港監(jiān)管科、蓮花港跨境電商監(jiān)管科、蓮花港旅檢科。