上海浦江海關，機構級別為正處級，承擔黃浦江自共青路碼頭至西渡段范圍內的港區(qū)（龍吳海關管轄區(qū)域除外）及相關海關監(jiān)管場所、沿線企業(yè)自管碼頭的各項海關業(yè)務。

機構設置:辦公室、行財科、人事政工科、督審科、綜合業(yè)務一科、綜合業(yè)務二科、綜合業(yè)務三科、綜合業(yè)務四科、原產地管理科、驗估一科、驗估二科、驗估三科、統(tǒng)計分析科、物流監(jiān)控科、查驗一科、查驗二科、查驗三科、查驗四科、旅檢科、船舶監(jiān)管科、法制科、技術科。