根據(jù)職能調(diào)整，伊犁自治州交通運(yùn)輸局的主要職責(zé)是

  （一）貫徹落實(shí)交通運(yùn)輸行業(yè)法律、法規(guī)、規(guī)章，起草有關(guān)地方性法規(guī)、政府規(guī)章草案和政策措施并監(jiān)督實(shí)施。

（二）擬訂公路、水路交通運(yùn)輸發(fā)展規(guī)劃、計(jì)劃并監(jiān)督實(shí)施。會(huì)同有關(guān)部門組織編制綜合運(yùn)輸體系規(guī)劃，參與擬訂交通物流業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略與規(guī)劃。

（三）承擔(dān)道路、水路交通運(yùn)輸綜合管理及其管理市場(chǎng)監(jiān)管工作。貫徹執(zhí)行自治區(qū)道路、水路運(yùn)輸有關(guān)政策、準(zhǔn)入制度、技術(shù)規(guī)范和運(yùn)營(yíng)規(guī)范。承擔(dān)運(yùn)輸線路、營(yíng)運(yùn)車輛、樞紐及運(yùn)輸站場(chǎng)的管理。指導(dǎo)城鄉(xiāng)交通運(yùn)輸協(xié)調(diào)發(fā)展和城鄉(xiāng)交通運(yùn)輸一體化，指導(dǎo)公共交通、出租汽車行業(yè)管理。負(fù)責(zé)公路、水路的銜接和協(xié)調(diào)。

（四）負(fù)責(zé)農(nóng)村公路建設(shè)、養(yǎng)護(hù)專項(xiàng)資金監(jiān)督管理。負(fù)責(zé)并指導(dǎo)交通行業(yè)財(cái)務(wù)、審計(jì)、統(tǒng)計(jì)工作。

（五）承擔(dān)公路、水路建設(shè)市場(chǎng)的監(jiān)管責(zé)任，維護(hù)交通建設(shè)市場(chǎng)公平競(jìng)爭(zhēng)秩序。負(fù)責(zé)交通基礎(chǔ)設(shè)施的規(guī)劃、建設(shè)和管理。貫徹執(zhí)行自治區(qū)公路、水運(yùn)工程建設(shè)有關(guān)制度和技術(shù)規(guī)范并監(jiān)督實(shí)施，承擔(dān)管轄交通建設(shè)項(xiàng)目的招投標(biāo)監(jiān)督管理、市場(chǎng)準(zhǔn)入、竣工驗(yàn)收和質(zhì)量監(jiān)督等工作。

（六）負(fù)責(zé)公路養(yǎng)護(hù)管理和路政管理工作，依法保護(hù)公路路產(chǎn)路權(quán)。負(fù)責(zé)公路安全保護(hù)工作。根據(jù)權(quán)限范圍，監(jiān)督指導(dǎo)貨運(yùn)車輛超限治理工作。

（七）指導(dǎo)交通運(yùn)輸行業(yè)體制改革。會(huì)同有關(guān)部門培育和管理交通運(yùn)輸市場(chǎng)、交通基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)市場(chǎng)、建立完善交通運(yùn)輸行業(yè)信用體系建設(shè)。

（八）負(fù)責(zé)交通運(yùn)輸行業(yè)安全生產(chǎn)監(jiān)督管理。負(fù)責(zé)運(yùn)行監(jiān)測(cè)和應(yīng)急處置協(xié)調(diào)工作，組織協(xié)調(diào)應(yīng)急重點(diǎn)物資和緊急客貨運(yùn)輸工作。

（九）貫徹執(zhí)行交通行業(yè)科技政策、技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)和規(guī)范；引導(dǎo)交通運(yùn)輸行業(yè)優(yōu)化結(jié)構(gòu)、協(xié)調(diào)發(fā)展。指導(dǎo)交通運(yùn)輸信息化建設(shè)，監(jiān)測(cè)分析運(yùn)行情況。指導(dǎo)交通運(yùn)輸行業(yè)環(huán)境保護(hù)和節(jié)能減排工作。

（十）監(jiān)督指導(dǎo)交通運(yùn)輸綜合行政執(zhí)法工作。指導(dǎo)交通運(yùn)輸行業(yè)的法制宣傳、行政復(fù)議、行政應(yīng)訴、行政執(zhí)法和監(jiān)督工作。指導(dǎo)交通運(yùn)輸行業(yè)職業(yè)教育和培訓(xùn)工作。

（十一）指導(dǎo)交通運(yùn)輸行業(yè)開(kāi)展國(guó)際經(jīng)濟(jì)技術(shù)合作與交流及利用外資工作。

（十二）完成自治州黨委、自治州人民政府交辦的其他任務(wù)。