2002年阜康市紅十字會實行機構(gòu)單設(shè)，核定事業(yè)編制2名，實行財政全額預(yù)算管理。2005年，升格為正科級建制，設(shè)有參公管理編制3名，工勤崗1名。

近年來，紅十字會大力弘揚“人道、博愛、奉獻”的精神，加強自身能力建設(shè)，深化“三救三獻”核心業(yè)務(wù)，加大紅十字文化宣傳，弘揚社會文明風(fēng)尚，有效發(fā)揮黨和政府橋梁紐帶作用，圓滿完成了各項工作任務(wù)并取得顯著成效。2008年榮獲自治區(qū)紅十字會抗震救災(zāi)先進集體；2016-2019年連續(xù)四年榮獲中國紅十字總會報刊宣傳先進集體；2014-2019年榮獲《紀念中國紅十字會建會110周年全國青少年紅十字運動和防災(zāi)減災(zāi)知識競賽試卷》三等獎；2017年、2019年榮獲自治區(qū)、昌吉州紅十字會應(yīng)急救護技能大賽第一名。