上海市科學技術委員會是主管全市科技工作的市政府組成部門，為正局級，加掛上海市外國專家局牌子。

上海市科學技術委員會主要職能包括：

1.貫徹執(zhí)行有關科技工作的法律、法規(guī)、規(guī)章以及創(chuàng)新驅動發(fā)展戰(zhàn)略方針。研究起草有關科技工作地方性法規(guī)、規(guī)章草案，擬訂科技發(fā)展以及引進國外智力規(guī)劃和政策，并組織實施。按照有關分工，推進建設具有全球影響力的科技創(chuàng)新中心。

2.研究提出科技體制改革的政策和措施，推進創(chuàng)新體系建設和科技體制改革，會同有關部門健全科技創(chuàng)新激勵機制。優(yōu)化科研體系建設，指導科研機構改革發(fā)展和新型研發(fā)機構建設，推動企業(yè)科技創(chuàng)新能力建設。協(xié)同推進軍民融合科技創(chuàng)新，承擔推進科技軍民融合發(fā)展相關工作。推進重大科技決策咨詢制度建設。

3.依托財政科技投入管理平臺和相關機制，建立統(tǒng)一的科研管理平臺和科研項目資金協(xié)調(diào)、評估、監(jiān)管機制。會同有關部門提出優(yōu)化配置科技資源的政策措施建議，推動多元化科技投入體系建設。協(xié)調(diào)管理財政科技計劃（專項、基金等）并監(jiān)督實施。

4.負責擬訂基礎研究發(fā)展規(guī)劃、政策并組織實施，研究提出重大基礎研究和應用基礎研究的重大任務并監(jiān)督實施，參與編制重大科技基礎設施建設規(guī)劃并監(jiān)督實施。負責管理上海市自然科學基金并組織實施。

5.負責牽頭推進研發(fā)與轉化功能型平臺建設，編制研發(fā)基地和研發(fā)公共服務平臺建設規(guī)劃，并組織實施和評估。擬訂重大科技創(chuàng)新基地建設規(guī)劃并監(jiān)督實施，組織實施科研條件保障建設和科技資源開放共享。

6.負責編制科技研究項目計劃并監(jiān)督實施，參與推進市級科技重大專項，統(tǒng)籌關鍵共性技術、前沿引領技術、現(xiàn)代工程技術、顛覆性技術研發(fā)和創(chuàng)新，牽頭組織重大技術攻關和成果應用示范。組織協(xié)調(diào)國際大科學計劃和大科學工程。

7.負責編制高新技術發(fā)展和科技促進社會發(fā)展的規(guī)劃、政策和措施。組織開展重點領域技術發(fā)展需求分析，提出重大任務并監(jiān)督實施。負責推動生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展。

8.負責擬訂科學技術普及工作規(guī)劃、政策并組織實施，推動科普工作創(chuàng)新發(fā)展。

9.牽頭技術轉移體系建設，擬訂科技成果轉移轉化、促進產(chǎn)學研結合的相關政策措施井監(jiān)督實施。指導科技服務業(yè)和科技中介組織發(fā)展，推動技術市場發(fā)展。

10.統(tǒng)籌區(qū)域科技創(chuàng)新體系建設，指導協(xié)調(diào)地區(qū)創(chuàng)新發(fā)展、科技資源合理布局和協(xié)同創(chuàng)新能力建設，推動科技園區(qū)建設。負責高新技術企業(yè)發(fā)展工作。

11.負責科技監(jiān)督評價體系建設和相關科技評估管理，指導科技評價機制改革，統(tǒng)籌科研誠信建設。

12.組織實施創(chuàng)新調(diào)查和科技報告制度。負責科技獎勵、科技信息、科技統(tǒng)計、科技保密和科技檔案工作。

13.實施科技人才培養(yǎng)工程，會同有關部門擬訂科技人才隊伍建設規(guī)劃和政策，建立健全科技人才評價和激勵機制，組織實施科技人才計劃，推動高層次科技創(chuàng)新人才隊伍建設。

14.負責引進國外智力工作。擬訂重點引進外國專家總體規(guī)劃、計劃并組織實施，建立外國頂尖科學家、團隊吸引集聚機制和重點外國專家聯(lián)系服務機制。擬訂出國（境）培訓｜總體規(guī)劃、政策和年度計劃并監(jiān)督實施。按照有關分工，負責外國人來華工作許可職責。

15.組織開展科技對外交往與創(chuàng)新能力開放合作以及科技人才交流工作。負責科技外事和國際科技合作工作。負責涉港澳臺科技合作與交流工作。

16.指導、協(xié)調(diào)和服務中央在滬科學研究機構的有關業(yè)務工作。會同有關部門負責對外資研發(fā)中心的管理服務。協(xié)同有關部門推進與科技相關的知識產(chǎn)權工作。

17.完成市委、市政府交辦的其他任務。

18.職能轉變。上海市科學技術委員會要加強、優(yōu)化、轉變政府科技管理和服務職能，完善科技創(chuàng)新制度和組織體系，加強宏觀管理和統(tǒng)籌協(xié)調(diào)，減少微觀管理和具體審批事項，加強事中事后監(jiān)管和科研誠信建設。從研發(fā)管理向創(chuàng)新服務轉變，深入推進科技計劃管理改革，建立公開統(tǒng)一的科技管理平臺，減少科技計劃項目重復、分散、封閉、低效和資源配置“碎片化”的現(xiàn)象。政府部門不直接管理具體科研項目，委托項目管理專業(yè)機構開展項目受理、評審、立項、過程管理、驗收等具體工作。進一步改進科技人才評價機制，建立健全以創(chuàng)新能力、質量、貢獻、績效為導向的科技人才評價體系和激勵政策。